La renouée du Japon forme des colonies très denses qui réduisent la diversité biologique végétale. Les berges où elle s'installe deviennent dénudées pendant l'hiver, ce qui accroît l'érosion des sols lors de la crue printanière et la quantité de sédiments qui se retrouvent dans l'eau.

Dans certaines conditions, l'arrachage manuel de cette plante envahissante est efficace et économiquement avantageux pour prévenir les invasions en milieu riverain.